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Espectrometría de masas en tándem (MS/MS)
La espectrometría de masas en tándem, o MS/MS, encadena dos análisis de masa: el primero selecciona un ion y el segundo mide los fragmentos que produce al romperse. En un péptido, la ruptura ocurre sobre todo en los enlaces de la cadena principal, y la serie de fragmentos permite leer la secuencia 1.
Iones b e y en la espectrometría de masas en tándem
Roepstorff y Fohlman propusieron en 1984 la nomenclatura que todavía se usa: los fragmentos que conservan el extremo N-terminal se llaman a, b y c, y los que conservan el C-terminal, x, y y z, según el enlace que se rompe 2. Con la disociación inducida por colisión, la más común, predominan los iones b e y 1.
De los fragmentos a la secuencia
Dos iones consecutivos de la misma serie difieren en la masa de un residuo, así que la escalera de diferencias se traduce en aminoácidos; la leucina y la isoleucina pesan lo mismo y no se distinguen por esta vía 1. La lectura complementa a la LC-MS, que confirma la masa de la molécula completa, y a la HPLC, que da la pureza.
La técnica también sigue a un péptido y a sus productos de degradación: Rahaman y colaboradores cuantificaron el TB-500 y sus metabolitos, en experimentos in vitro y en ratas, con MS/MS de alta resolución 3.
Fichas donde aparece Espectrometría de masas en tándem (MS/MS)
Referencias
- Steen H, Mann M. The ABC's (and XYZ's) of peptide sequencing. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2004;5(9):699-711. PMID 15340378. Fuente
- Roepstorff P, Fohlman J. Proposal for a common nomenclature for sequence ions in mass spectra of peptides. Biomedical Mass Spectrometry, 1984;11(11):601. PMID 6525415. Fuente
- Rahaman KA, et al. Simultaneous quantification of TB-500 and its metabolites in in-vitro experiments and rats by UHPLC-Q-Exactive orbitrap MS/MS and their screening by wound healing activities in-vitro. Journal of Chromatography B, 2024. PMID 38382158. Fuente
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